今天就先介绍到这里！epic官网首页信任民众都传闻过starbase，很火，是的，连尝试外包公司都用它，能不火嘛！然则你对它真正了然众少呢？好啦，下面咱们就来体系的先容一下它。最先，官网所正在要真切：
以hsa-let-7a-5p为例，通过左侧面板举办整个树立。好比咱们探索人体内该miRNA的维系靶标时，举办如下树立即可。此中mammal代外哺乳动物，CLIP Data能够调度声援CLIP-seq尝试的次数以局限预测的苛厉性，Program Number选拔尝试数目，Predicted Program能够选拔操纵哪些预测软件来举办预测：
接下来咱们能够点击基因GNG5地点行的Pan-Cancer地点列的数字6
能够发明has-let-7a-5p与靶基因GNG5正在6个肿瘤疾病中呈负干系性。
当咱们念真切某一miRNA是否和某一整个mRNA是否有维系时，能够同时输入miRNA和mRNA音讯，如下图，提交即可
当然，咱们也能够凭据某一特定mRNA来预测与其维系的miRNA，如图所示，输入经过同上，只是microRNA一栏空置不要输入，结果如下，赤色方框即为与方针基因ACTB维系的全部miRNA。
供给了一种阐发RNA降解形式的归纳门径，针对miRNA介导的降解片断举办测序，筛选占定miRNA调控的靶基因，无误性更高。包蕴2个子模块，即miRNA-mRNA和miRNA-ncRNA。这里咱们以miRNA-mRNA为例，阐发miRNA定向切割的靶标。
整个操作门径如1，这里咱们以hsa-let-7a-2-3p为例，举办后续阐发。提交后结果如下：
该模块为目前可用的各类细胞类型供给了最完善的RBP-ncRNA互相效用。该模块有5个子模块，包含RBP-mRNA、RBP-lncRNA、RBP-pseudogene、RBP-circRNA 及RBP-sncRNA。维系shRNA筛选数据和确凿的RBP-RNA互相效用，咱们体系地物色了K562和HepG2细胞系中敲除RBP时RBP靶标的反响。以RBP-mRNA互相效用为例，物色一下有众少RBP能够调动mRNA-TP53。整个操作同上，均是点点点，只不外咱们这里“RBP”参数下输入“all”，“target”参数下输入“TP53”，然后提交即可。整个结果证明同上。
好啦，本日就先先容到这里。原本这个数据库全部操作起来并不难，当咱们不了解整个什么乐趣时尽能够点点点，宽心，电脑不会坏。
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